五脏六腑，惟三焦一腑《内经》言之最详，《难经》又加发明，愈益畅尽，后人不信三经，妄生臆说。如《龙川志》云：有徐遁者，见一饿夫，脔割殆尽，而骨脉尚全，往视其脏，见右肾下有脂膜如掌大，正与膀胱相对，有二白脉，夹脊贯脑，以此为三焦。马玄台《素问解》又分割右肾以为三焦之腑，是皆一焦而非三焦矣。李东垣又分手足三焦，是为六焦而非三焦矣。张景岳《类经》以有名无形一语为非，是而以躯壳之边际为三焦，是泥其外而遗其中矣，皆与经文不相符也。按先正云三焦取火，能腐物之义，火之性，自下而上。三焦者，始于原气，由于中脘，散于膻中，皆相火之自下而上者也。上焦主纳而不出，下焦主出而不纳，其纳其出，皆系乎中焦之腐熟，焦之为义可见矣。张景岳三焦、包络、命门辨其略曰：《难经》曰心主与三焦为表里，俱有名而无形。叔和、启玄而下皆宗之，二子不能辨，孰敢再辨，至徐遁、陈无择始创言三焦之形，有脂膜如掌大〔批：以其无脏可配，故曰孤府，以其独包众脏，亦曰孤府也〕，正与膀胱相对。予遍考《内经》，曰：三焦者，中渎之腑，水道出焉，属膀胱，是孤之腑也。曰：密理厚皮者，三焦膀胱厚；粗理薄皮者，三焦膀胱薄。以及缓急直结，各有所分。曰：勇士三焦理横，怯士其焦理纵。曰：上焦开发，宣五谷味，熏肤充身泽毛，是谓气；中焦受气，取汁变化而赤，是谓血。曰：营出中焦，卫出下焦。曰：上焦出胃上口，贯膈而布胸中；中焦亦并胃中，出上焦之后，化精微而为血；下焦别回肠，注于膀胱而渗入焉，水谷居于胃中，成糟粕下于大肠而成下焦。曰：上焦如雾，中焦如沤，下焦如渎。其在心包络，则曰：诸邪之在于心者，皆在于心之包络。夫三焦既无形矣，何以有水道之出？有厚薄缓急、直结纵横之分，何以如雾、如沤、如渎，及气血之别？心主亦曰无形矣，则代心而受邪者，受之何所？即此经文，有无可见。夫所谓〔批：此即释氏所谓臭皮囊也〕三焦，象三才也。焦者，象火也，色赤，属阳之谓也。夫人之一身，外自皮毛，内自脏腑，其腔腹周围上下，全体状若大囊者，果何物乎？其着内一层，形色最赤，象如六合，总统诸阳，是非三焦而何？至其相配表里，则三焦为脏腑之外卫，心包络为心主之外卫，如帝阙之重城，故皆属阳，均称相火，而其脉络相通，允称表里，此固甚明，无容辨也。客曰：既三焦、心主为表里，何以复有三焦、命门表里之说？余曰：《内经》初无命门之名，惟《根结》《卫气》《阴阳离合》等篇有曰：命门者，目也。此盖指太阳经穴终于睛明。此外并无左右肾之分及右肾为命门之说也。命门之始，起于《难经》，曰：肾有两者，非皆肾也，左者为肾，右者为命门。命门者，精神之所舍，原气之所系，男子以藏精，女子以系胞。王叔和因之，而曰肾与命门俱出尺部，后世致有命门三焦之配，《内经》实所无也。《黄庭经》曰：上有黄庭下关元，后有幽阙前命门。又曰：丹田之中精气微，玉房之中神门户。梁丘子注曰：男以藏精，女以约血，故曰门户。元阳子曰：命门者，下丹田精气出飞之处也。《脉经》又曰：左为肾，右为子户。所谓子户，即子宫也，俗名子肠，居直肠之前，膀胱之后，当关元、气海之间，男女精血，皆存乎此，而子由此出，又子宫者，男女之通称。道家以先天真一之气藏乎此，为九还七返之基，故曰丹田。医家以冲任之脉盛于此，名曰血室。以气之呼接乎天根，气之吸接乎地根，又名气海，实则一子宫耳。在女子，可以手探而得，俗名产门；在男子，精泄之时，自有关阑知觉。父母交会之际，施由此出，受由此入，谓非先天立命之门户乎？夫命门者，子宫之门户也；子宫者，肾脏藏精之腑也；肾脏者，先天真一之气，北门锁钥之司也。而所以为锁钥者正赖命门之闭固〔批：数语得之，若云藏胎则亦偶数矣，尚得为奇乎〕，蓄坎中之真阳，以为一身生化之原也。坎卦内奇而外偶，肾两者，坎外之偶也；命门一者，坎中之奇也。命门总主乎两肾，两肾皆属于命门，为水火之腑，阴阳之宅，精气之海，死生之窦。若命门亏损，则五脏六腑皆失所恃，而阴阳病变无所不至矣。医不知此，尚安足云。愚按：《难经》所云三焦有名，无形者，盖指上、中、下之空处而言。景岳以为有形者，盖指躯壳之边际而言。两人所说，实共一物也。愚窃以理推究之，则《难经》之义为长。夫景岳以躯壳之边际为一大腑，此与《内经》所谓孤腑、《难经》所谓外腑两说相合，特从前未经道破，而景岳又由焉而不知者耳。但三焦之用，实在于中央之空处，而不在于四旁之边际也。老子曰：三十辐共一毂，当其无有车之用；埏埴以为器，当其无有器之用；凿户牖以为室，当其无有室之用。故有之以为利，无之以为用，夫车器室三者，皆有也。然车之载物，器之受物，室之便居处利出入者，则在于空无之处也。经曰：宗气积于上焦，营气出于中焦，卫气出于下焦。又曰：上焦贯膈而布胸中，中焦化精微而为血，下焦注膀胱而渗入。是其所以絪缊宗气，变化精血，流行营卫，与夫贯膈、布胸、别回肠、注膀胱者，将在于无形之中央乎，抑在于有形之边旁乎。经又曰：上焦如雾，中焦如沤，下焦如渎。夫雾与沤皆结于空中，似有而无之物也。渎所以行水而非水，亦空无之地也，是《内经》数说，悉皆归重于无形之空处，而非创自于《难经》矣。景岳特据厚薄、直结、纵横以为辨，是皆执有之过，而未达夫用无之妙，遂致轻议古人，不知古人已得其精，已适得其粗耳。《难经》曰：三焦者，水谷之道路，气之所终始也。上焦在胃上口，主内而不出，其治在膻中两乳间；中焦在胃中脘，主腐熟水谷，其治在脐旁；下焦当膀胱上口，主分别清浊，主出而不内，其治在脐下一寸。又曰：三焦主持诸气，有名而无形，其经属手少阳，此外腑也。又曰：三焦所行之俞为原，何也？脐下肾间动气者，人之生命也，十二经之根本也，故名曰原。三焦者，原气之别使也，主通行三气，经历于五脏六腑。原者，三焦之尊号也，故所止辄为原五脏六腑之有病者，皆取其原也。夫既曰主持诸气，又曰经历五脏六腑，而又称为外腑，岂非以三焦兼包内外，能统五脏六腑，能通行于十二经络也乎。《难经》又曰：小肠谓赤肠，大肠谓白肠，胆谓青肠，胃谓黄肠，膀胱谓黑肠，下焦之所治也，是明言下焦兼包五腑矣，岂上中二焦独不能兼包诸脏乎？是景岳腔腹大囊之说，《难经》久已兼及之，景岳特看书未透耳。又按：华元化《中藏经》曰：三焦者，三元之气也，号曰中清之腑，总领五脏六腑，营卫经络，内外左右上下之气也。三焦通，则内外、左右、上下皆通也，其于周身灌体，和内调外，营左养右，导上宣下，莫大于此也。其言正与《难经》同，何待景岳之置辨乎？若夫肾有两枚，皆属乎水，惟中央命门一点真阳属火，所以成坎卦，而正位乎北也。故《易》曰：坎者，水也，正北方之卦也，劳卦也，万物之所归也。盖以命门相火，能代心君行事，凡人之主云为而应万事，蒸糟粕而化精微，皆赖此相火之运用，故曰劳卦，故为万物之所归，以易象观之，其理甚明。《难经》《脉经》皆分左为肾，右为命门，而以命门配于右尺。夫《灵》《素》并无命门之名，而十二经中又无命门之络，何以能见脉于右尺，能配三焦而称表里也哉？此实从来相沿之误，须赖后贤为之裁正者也。张景岳乃以命门属之子宫产门，不知命门在两肾之中央，藏先天之真火〔批：□子所谓火传不知其□也〕，为生身之根蒂。男女媾精之时，皆禀此命火以受胎，人之穷通寿天，皆本乎此。在夹脊第七节，犹北辰居其所而不动。《内经》所谓七节之旁中有小心，老氏所谓玄牝之门，为天地根，正谓此也。盖指此为藏精之宫则可，指为泄精之处则不可。指为系胎之根则可，指为藏胎之地则不可。若命门之大可以容胎，是特裒然一革囊而已，其何以停育，元精、元神、元气子一离宫，此中之精气尽泄，尚赖何者以为安身立命之基乎？景岳看《难经》未明，致多三焦一辨，已属骈枝，又不识命门真面目，而以子宫、子肠当之，且混认丹田、气海便是子肠，以为九还七返之基正在于此，不亦大可骇乎。此愚之瞽说，特加辨析，以听识者之论定焉。《续医说》亦有辨三焦为有形一篇，议论尤为不畅，不足置辨。
三焦命门系乎躯命者甚大，古今之论甚夥，求其确得真诠而无疑议者，实未易见甚矣，斯道之至精至微而言之不易也。