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因明入正理论疏后记，三卷，唐智周撰，下卷不全。简称《后记》。因明著作。是对《前记》的修改和增删。对基疏所解《入论》同喻体“因同品”三字连读一句作详细明白注释,并解释了窥基关于同喻体的问答与关于第二相的问答之区别,即同喻体与因第二相组成方式的差别。关于十四过类疏归属,《后记》中有“如轨法师疏,当广分别也”,它表明十四过类疏应为文轨所撰。

因明入正理论续疏下卷，唐慧沼述，日本藏俊题记，佚名题记，信宪题记。简称《续疏》。因明著作。分上、下卷。唐慧沼续。窥基《大疏》是未成之作,能立不成以下由慧沼补足。南京支那内学院版《续疏》的《校者附记》认为“沼续纂文,乃成足本。故其门人道邑、智周,皆遵以注记,不复区分。迨后另行略本,则从沼疏删订以成之也。”通过答问方式解答大量的问难与异见来疏解《入论》原文。与文轨《庄严疏》所同者有四,破轨疏者亦有四。答难时,有二解者,则以二解并存,即使二解前后矛盾亦不分真似。在举例方面也不无瑕疵。《续疏》作为定稿本比未定稿的基疏简明易读。既继承基疏精神,又避免基疏缺陷。基疏足本更易流通并能成为汉传因明的圭臬,《续疏》起到一定作用。

遗教经论住法记，一卷，宋元照述并序，日本祖泰跋，有科文。

遗教经论记，三卷，宋观复述并序及题记，善服后序，日本淨确题记。

因明入正理论疏，卷上，唐文轨述，日本快道题记，缺卷中、下。

因明入正理论疏抄略记，一卷，唐智周撰，日本胤兼题记，又云因明论疏抄。

因明入正理论解，一卷，明真界集解并跋，冯梦祯序，有科文

因明入正理论集解，一卷，明王肯堂集解并序。

因明入正理论直疏，一卷，明明昱疏，大善序，相宗八要解第六。

因明入正理论直解，一卷，明智旭述，相宗八要直解第一。

判比量论，一卷，新罗元晓述，惟存跋文、题记。

三支比量义钞，一卷，唐玄奘立，宋延寿造，明明昱钞，相宗八要解第七。

真唯识量略解，一卷，明智旭略解，内题唐玄奘师真唯识量略解，相宗八要直解第六（目录失注）。

肇论疏科，一卷，宋遵式排定，前有序科，晓月排定。

夹科肇论序注，一卷，宋晓月注。

注肇论疏，六卷，宋遵式述并序。

肇论新疏游刃，三卷，宋文才述。

肇论略注，六卷，明德清述，陈慧达原序节录，明慧浸跋。

物不迁正量证，一卷，明道衡述，无似道人跋，内题证上有论字。

物不迁正量论，二卷，明镇澄著并序，李天麟序。

物不迁论辩解，一卷，明真界解并序，冯梦祯序，袾宏跋，达观跋。

表无表章栖翫记，一卷，宋守千述，日本高范题记。

唯识开蒙问答，二卷，元云峯集，明大真重刻序。

八识规矩补注证义，一卷，明明昱证义并序，相宗八要解第八。

八识规矩略说，一卷，明正诲略说并序。